国家清障车合格证工作机构公布了车管所注册登记时比对不成功的比率，经过总结，比对不成功率高的主要原因如下: 1、没有及时上传整车清障车合格证信息，车主到车管所不能登上户2派盘没有及时上传，导致改装车企业相应的改装车不能进人核查库，车主到车管所不能登记注册。3、发动机号错，一般原因是没按规定坡写. 4,VIN错写不同的清障车合格证编号，相同的VIN码，同一辆车存在两个清障车合格证，前一张没撤销，且后一张无法上传，导致无法注册登记。
为此2007年11月9日国产清障车合格证工作管理办公室提出的整改措施如下: l、保证每打印一张清障车合格证，立即上传清障车合格证信息，保证车辆注册登记时能上传的清障车合格证编号，以后清障车合格证工作机构将强制要求清障车合格证打印后2个工作日内上传，如果2个工作日内不上传的，清障车合格证工作机构将不予接收。2、改装车在上传合翻正信息时要在底盘清障车合格证信息已上传到了清障车合格证数据库中基础上进行。3,保证发动机号的填写完全符合发动机型号汗序号韵规则要求。4,保证VIN唯一对应-台车辆。
目前，全国各地车管所在车辆注册登已经开始比对比清障车合格证信息，但暂时只作为监控内容，不做为强制比对依据。根据公安部和发改委协商的结果，计划2008年1月1日正式开始强制比对的工作，所以要求各企业认真整改本企业清障车合格证打印、上传流程，检查打印、上传软件和设备的可靠性，防止出现异常情况影响清障车合格证上传，以致影响车辆注册工作.